Филогенетические связи Plectascales рисуются в следующем виде. Низшие представители, как Gymnoasceae, довольно тесно примыкают к Protascales специально к Endomycetaceae. Образование аскогенных гиф, свойственное Gymnoascaceae, в зачатке наблюдается иногда и у Endomyces. Например, у End. lindneri наблюдалось известное разрастание из места слияния двух клеток и образование не одной, а двух сумок.
От Gymnoascaceae прямо вверх выводятся Aspergillaceae. У них черты Plectascales выражены наиболее типично, и поэтому они занимают здесь центральное положение. Морфологически к ним довольно близки Onygenaceae, специализированные по условиям существования. Elaphomycetaceae и Terfeziaceae специализированы в другом направлении: приспособления к подземной жизни и микоризообразованию. Они представляют известные черты сходства с Тиberales, но это, всего вероятнее, результат одинакового образа жизни (подземные грибы), т. е. представляется конвергенцией. Что касается, наконец, Myriangiaceae, то эта группа, примыкая низшими представителями к Gymnoascaceae, высшими значительно уклоняется от остальных Plectascales. Параллельное расположение сумок и их цилиндрическая форма у Pleospora напоминает следующий порядок Perisporiales и даже Sphaeriales. У близкой к ней Leptosphaeria еще больше сходства с Sphaeriales. У одних видов этого рода (L. doliorum) строение напоминает Pleospora, а у других (L. acuta) имеются типичные перитеции с отверстием на вершине и настоящие парафизы между сумками, как это свойственно Sphaeriales, куда часто и относят Leptosphaeria.