Последняя большая группа грибов — Fungi imperfecti, как обнимающая чисто бесполые состояния грибов, не укладывается в рамки филогенетической системы, строящейся на основе полового воспроизведения. Правда, весьма вероятно, что большинство несовершенных грибов имеет свои корни среди аскомицетов как бесполые конидиальные состояния последних. Однако, где это фактически доказано нахождением сумчатых стадий, там соответственная форма переносится к аскомицетам, огромное же большинство других остается в том же неопределенном положении. Возможно, что некоторые из них имеют иные родственные связи, например, с базидиомицетами. Так как мы не имеем данных для решения такого рода вопросов, то поэтому классификация несовершенных грибов, совершенно необходимая ввиду обширности этой группы, строится на других принципах, представляя пример искусственной системы. В подробностях она не одинакова у разных авторов.